听命于国民政府的部队只有中央军，本质上讲，是听命于蒋介石控制的中央政权的地方军阀，中央军控制着华东五省，以华东五省作为财源和补给基地，抗战后撤退至河南、四川、陕西。蒋介石只是全国各派名义上的首领。所能控制的，只有中央军以及中央军占领的地盘。
蒋介石国民党军队分为地方部队和中央军两类，地方部队在战斗中逐渐被收编，成国中央军旁系部队。
各省新军部队在争斗中逐渐演变：
一类是有军队也有地盘的，称为地方部队。地方部队主要有桂系、粤系、晋系、滇系、西北军、东北军和其它地方军阀，这些其他武装具有相当的独立性，把持地方政权、财权。
粤军是北伐军的主力，1926年刚开始北伐时，蒋介石的嫡系部队只有一个第1军，辖三师九团，到1927年，第1军就扩编为下辖六个师，到1933年，蒋介石的嫡系部队已经有三十个左右的师了。也就是说，短短的六、七年的光景，蒋介石的嫡系部队由一个军的实力，激增到三十个军的实力。（北伐时，是军-师-团的编制，而1933年，是师-旅-团的编制，所以，这时候的“师”，几乎相当于北伐时的“军”。）
国民党中央军以与蒋介石亲疏关系来看，分为嫡系中央军、旁系中央军。
中原大战时期，严格意义的中央军只有6个师，这是蒋军嫡系的雏形。
第1师：北伐时期的刘峙第2师，后来交到胡宗南手上，扩展了第1军，“西北王”的核心部队。
第2师：北伐时期的第3师、第14师等合成，师长先后有顾祝同/楼景樾/黄杰/郑洞国等，后与25师合编为关麟徴的52军。
第3师：北伐时期的第20师，师长先后有钱大钧/陈继承/李玉堂，后来发展为第10军，以方先觉守衡阳闻名。
第9师：北伐时期王柏龄的第1师。北伐中在南昌受创，回后方整编，重编序列后为第9师，后来发展为蒋鼎文/李延年的第2军。
第10师：由两部组成，一是黔军王天培部的残余，师长杨胜治/方鼎英，二是国民军方振武投蒋后编成的45师，师长卫立煌。后来第10师与45师合并，仍称第10师，师长卫立煌、李默庵，由于部队渊源不好，以及卫立煌与蒋介石的关系一般，这一部又称中央军的杂牌。
第11师：原福建周荫人部，投降北伐军，先编成17军，后改11师，师长曹万顺/陈诚。这是陈诚“土木系”的根基。
中原大战后，又按德式编制建成了张治中的教导师，随后教导师一分为三，教1师冯轶裴、教2师张治中、教3师钱大钧。教1师发展的36、87、88师即后来的七十一军；教2师发展为第4、25师，第4师是汤恩伯系的班底，25师编入关麟徴52军；教3师发展为第14、89师，后来14师归陈诚，89师归汤恩伯。
蒋介石中央军中又形成胡宗南系、何应钦系、陈诚土木系、汤恩伯系以及戴笠系为主的派系势力，几大派系间争权夺利，勾心斗角。
旁系中央军是，在军阀混战中被蒋（或其他军阀）打败，失去地盘，编入中央序列，但是仍保持相对独立人事体系的。
这些部队出于地方实力派，失去势力后仍与地方保持着千丝万缕的联系，例如广东的19路军、广东的薛岳、湖南的谭延闿、鲁涤平等部。
湖南谭延闿的第2军，北伐后未能在湖南立足，曾先后在浙江、江西等地驻防，由于没有固定地盘，听命于蒋介石，编成张辉瓒18师（江西被歼）、谭道源50师、李韫珩53师，这支部队后来追击红军到了陕西，被胡宗南兼并。
赵恒惕的部将贺耀组随唐生智一起南投，编为第8师，师长陶峙岳，后来也归并胡宗南系。
云南朱培德的第3军，当时有第7师、12师。第3军的番号一直保留到该部队的最后。
广东第4军之薛岳部、蒋光鼐部。陈济棠取得广东地盘后，这两支无家可归的粤军也在中央均等编制内，但是由于各种因素，蒋光鼐部（60、61、49、78）一般还是被当作粤军看待。薛岳部有时也被称粤军，但是应该说已经中央化了，最初编为90师，后来兼并其他杂牌增加了一个59师。
二藓疥之疾心腹之患